醫院一般分為綜合性醫院和傳染病醫院兩大類。醫院污水就其污染物的種類及濃度與城市糞便污水相近，但并不*一致。因為除一般污染物外，醫院污水中還含有一些特殊的污染物，如藥物、消毒劑、診斷用劑、洗滌劑等。

醫院污水主要源于各種病房，特別是各種傳染病房、手術室、洗衣房所排污水，除含有大量病源微生物，寄生蟲卵如蛔蟲卵及各種病毒如肝炎病毒、肺結核菌和痢疾菌等外，還含有大量污染物，其中有機物質占污染總量的60%左右，不溶解物質約占總量的40%。由于大量不容物質如肌肉組織等沉淀時，將比重較大的蠕蟲及其卵、大量細菌等一起沉淀在污泥中。

近年來，醫療中廣泛使用了放射性同位素如，這些醫療用具常用水沖洗，因此，沖洗污水中會含有放射性同位素。根據國家《醫療》 我公司根據醫療門診可用面積小，污水量少的特點，經過多年研究攻關終于設計了一系列小型污水處理設備，該設備采用格柵+過濾+消毒的處理工藝，具有占地面積少、無噪音、無二次污染、安裝方便、一次性投資少,維護簡單、容易達標等優點，現已被廣泛用于寵物醫院、醫療門診、實驗室等污水處理工程?！?/span>

另外，有的醫院還設有附屬制藥廠，其排水中含有酸堿等有害物質，由此可見，醫院污水須經過消毒、脫污等方可排入江河中。